Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LOXL3P58215 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms