Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SAA2P0DJI9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAA2P0DJI9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms