Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RD3LP0DJH9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
RD3LP0DJH9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RD3LP0DJH9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RD3LP0DJH9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RD3LP0DJH9 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms