Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms