Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC2P0DI81 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC2P0DI81 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC2P0DI81 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC2P0DI81 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC2P0DI81 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC2P0DI81 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC2P0DI81 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC2P0DI81 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC2P0DI81 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC2P0DI81 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC2P0DI81 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC2P0DI81 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC2P0DI81 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC2P0DI81 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAPPC2P0DI81 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAPPC2P0DI81 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAPPC2P0DI81 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAPPC2P0DI81 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAPPC2P0DI81 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC2P0DI81 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms