Protein–RNA interactions for Protein: O95857

TSPAN13, Tetraspanin-13, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13O95857 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TSPAN13O95857 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TSPAN13O95857 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TSPAN13O95857 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
TSPAN13O95857 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TSPAN13O95857 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
TSPAN13O95857 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TSPAN13O95857 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
TSPAN13O95857 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TSPAN13O95857 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TSPAN13O95857 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TSPAN13O95857 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TSPAN13O95857 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TSPAN13O95857 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TSPAN13O95857 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
TSPAN13O95857 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TSPAN13O95857 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TSPAN13O95857 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TSPAN13O95857 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TSPAN13O95857 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TSPAN13O95857 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TSPAN13O95857 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms