Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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CLDN9O95484 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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CLDN9O95484 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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CLDN9O95484 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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CLDN9O95484 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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