Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRD1A4D1F6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRD1A4D1F6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms