Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3Q9UKS6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms