Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE7

MCEE, Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCEEQ96PE7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms