Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN9

ZNF488, Zinc finger protein 488, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF488Q96MN9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ZNF488Q96MN9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms