Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms