Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW33

GTSF1, Gametocyte-specific factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTSF1Q8WW33 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTSF1Q8WW33 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTSF1Q8WW33 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTSF1Q8WW33 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTSF1Q8WW33 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTSF1Q8WW33 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTSF1Q8WW33 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTSF1Q8WW33 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTSF1Q8WW33 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTSF1Q8WW33 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTSF1Q8WW33 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTSF1Q8WW33 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTSF1Q8WW33 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTSF1Q8WW33 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTSF1Q8WW33 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTSF1Q8WW33 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTSF1Q8WW33 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTSF1Q8WW33 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTSF1Q8WW33 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTSF1Q8WW33 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTSF1Q8WW33 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTSF1Q8WW33 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTSF1Q8WW33 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTSF1Q8WW33 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTSF1Q8WW33 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTSF1Q8WW33 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTSF1Q8WW33 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GTSF1Q8WW33 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTSF1Q8WW33 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTSF1Q8WW33 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTSF1Q8WW33 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTSF1Q8WW33 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTSF1Q8WW33 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTSF1Q8WW33 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTSF1Q8WW33 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTSF1Q8WW33 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTSF1Q8WW33 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTSF1Q8WW33 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTSF1Q8WW33 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTSF1Q8WW33 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
GTSF1Q8WW33 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.1
GTSF1Q8WW33 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GTSF1Q8WW33 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms