Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCG5

CHST4, Carbohydrate sulfotransferase 4, humanhuman

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST4Q8NCG5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHST4Q8NCG5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHST4Q8NCG5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHST4Q8NCG5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHST4Q8NCG5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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