Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCAQ16586 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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