Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1I3Q14994 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
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