Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTN3Q08043 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms