Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms