Protein–RNA interactions for Protein: P24310

COX7A1, Cytochrome c oxidase subunit 7A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX7A1P24310 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COX7A1P24310 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COX7A1P24310 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COX7A1P24310 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COX7A1P24310 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COX7A1P24310 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COX7A1P24310 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
COX7A1P24310 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX7A1P24310 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms