Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOC3P02656 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC3P02656 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC3P02656 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC3P02656 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC3P02656 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC3P02656 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC3P02656 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC3P02656 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC3P02656 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC3P02656 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC3P02656 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC3P02656 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC3P02656 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC3P02656 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC3P02656 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC3P02656 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC3P02656 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC3P02656 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC3P02656 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC3P02656 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC3P02656 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC3P02656 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC3P02656 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC3P02656 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC3P02656 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC3P02656 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC3P02656 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC3P02656 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOC3P02656 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
APOC3P02656 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
APOC3P02656 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOC3P02656 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOC3P02656 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
APOC3P02656 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOC3P02656 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
APOC3P02656 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOC3P02656 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
APOC3P02656 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOC3P02656 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APOC3P02656 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APOC3P02656 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOC3P02656 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOC3P02656 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOC3P02656 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOC3P02656 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APOC3P02656 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOC3P02656 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOC3P02656 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOC3P02656 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOC3P02656 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOC3P02656 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOC3P02656 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOC3P02656 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOC3P02656 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOC3P02656 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOC3P02656 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOC3P02656 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOC3P02656 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOC3P02656 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOC3P02656 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
APOC3P02656 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOC3P02656 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOC3P02656 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOC3P02656 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOC3P02656 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOC3P02656 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOC3P02656 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOC3P02656 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOC3P02656 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOC3P02656 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOC3P02656 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOC3P02656 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOC3P02656 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOC3P02656 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOC3P02656 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOC3P02656 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOC3P02656 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOC3P02656 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOC3P02656 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOC3P02656 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
APOC3P02656 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOC3P02656 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOC3P02656 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOC3P02656 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOC3P02656 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOC3P02656 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOC3P02656 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOC3P02656 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC3P02656 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC3P02656 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC3P02656 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC3P02656 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC3P02656 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC3P02656 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC3P02656 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC3P02656 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC3P02656 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC3P02656 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOC3P02656 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms