Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APEX2Q9UBZ4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
APEX2Q9UBZ4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms