Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms