Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK2

RIPOR3, RIPOR family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPOR3Q96MK2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPOR3Q96MK2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RIPOR3Q96MK2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPOR3Q96MK2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPOR3Q96MK2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPOR3Q96MK2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPOR3Q96MK2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPOR3Q96MK2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPOR3Q96MK2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPOR3Q96MK2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPOR3Q96MK2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPOR3Q96MK2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPOR3Q96MK2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPOR3Q96MK2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPOR3Q96MK2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPOR3Q96MK2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPOR3Q96MK2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPOR3Q96MK2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPOR3Q96MK2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPOR3Q96MK2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPOR3Q96MK2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPOR3Q96MK2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPOR3Q96MK2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPOR3Q96MK2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPOR3Q96MK2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPOR3Q96MK2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPOR3Q96MK2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPOR3Q96MK2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPOR3Q96MK2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPOR3Q96MK2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPOR3Q96MK2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPOR3Q96MK2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPOR3Q96MK2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPOR3Q96MK2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPOR3Q96MK2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPOR3Q96MK2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPOR3Q96MK2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPOR3Q96MK2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPOR3Q96MK2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPOR3Q96MK2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPOR3Q96MK2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPOR3Q96MK2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPOR3Q96MK2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPOR3Q96MK2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPOR3Q96MK2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPOR3Q96MK2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPOR3Q96MK2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPOR3Q96MK2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPOR3Q96MK2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPOR3Q96MK2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPOR3Q96MK2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms