Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SFT2D1Q8WV19 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SFT2D1Q8WV19 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
SFT2D1Q8WV19 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SFT2D1Q8WV19 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SFT2D1Q8WV19 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFT2D1Q8WV19 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFT2D1Q8WV19 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SFT2D1Q8WV19 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFT2D1Q8WV19 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFT2D1Q8WV19 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFT2D1Q8WV19 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFT2D1Q8WV19 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFT2D1Q8WV19 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFT2D1Q8WV19 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFT2D1Q8WV19 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFT2D1Q8WV19 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFT2D1Q8WV19 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFT2D1Q8WV19 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D1Q8WV19 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D1Q8WV19 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D1Q8WV19 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D1Q8WV19 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D1Q8WV19 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D1Q8WV19 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D1Q8WV19 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D1Q8WV19 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D1Q8WV19 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D1Q8WV19 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D1Q8WV19 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D1Q8WV19 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D1Q8WV19 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D1Q8WV19 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D1Q8WV19 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D1Q8WV19 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D1Q8WV19 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D1Q8WV19 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D1Q8WV19 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D1Q8WV19 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D1Q8WV19 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D1Q8WV19 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D1Q8WV19 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D1Q8WV19 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D1Q8WV19 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFT2D1Q8WV19 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms