Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDCL2Q8N4E4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCL2Q8N4E4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCL2Q8N4E4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms