Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR52

ZNF493, Zinc finger protein 493, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF493Q6ZR52 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF493Q6ZR52 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF493Q6ZR52 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms