Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRIG3Q6UXM1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms