Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 MBD1-219ENST00000589733 767 ntTSL 214.67□□□□□ -0.061e-6■■■■■ 42
EFTUD2Q15029 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 42
EFTUD2Q15029 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.359e-7■■■■■ 42
EFTUD2Q15029 TSEN54-208ENST00000583173 798 ntTSL 521.03■□□□□ 0.969e-7■■■■■ 42
EFTUD2Q15029 TSEN54-207ENST00000580013 568 ntTSL 421.03■□□□□ 0.969e-7■■■■■ 42
EFTUD2Q15029 TSEN54-202ENST00000434205 627 ntTSL 515.82■□□□□ 0.129e-7■■■■■ 42
EFTUD2Q15029 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.96e-8■■■■■ 42
EFTUD2Q15029 CPSF1-214ENST00000622776 1029 ntTSL 522.05■■□□□ 1.121e-6■■■■■ 42
EFTUD2Q15029 HSPA8-219ENST00000532780 1194 ntTSL 217.6■□□□□ 0.411e-12■■■■■ 42
EFTUD2Q15029 HSPA8-206ENST00000525624 1048 ntTSL 513.05□□□□□ -0.321e-12■■■■■ 42
EFTUD2Q15029 HSPA8-210ENST00000527387 579 ntTSL 412.56□□□□□ -0.41e-12■■■■■ 42
EFTUD2Q15029 HSPA8-217ENST00000532182 674 ntTSL 410.66□□□□□ -0.71e-12■■■■■ 42
EFTUD2Q15029 HSPA8-212ENST00000528292 1112 ntTSL 25.74□□□□□ -1.491e-12■■■■■ 42
EFTUD2Q15029 HSPA8-216ENST00000532167 570 ntTSL 44.43□□□□□ -1.71e-12■■■■■ 42
EFTUD2Q15029 HSPA8-205ENST00000525463 583 ntTSL 53.53□□□□□ -1.841e-12■■■■■ 42
EFTUD2Q15029 SEMA7A-204ENST00000567345 674 ntTSL 418.02■□□□□ 0.482e-7■■■■■ 42
EFTUD2Q15029 DVL2-206ENST00000574591 615 ntTSL 315.29■□□□□ 0.041e-15■■■■■ 42
EFTUD2Q15029 DVL2-215ENST00000577154 541 ntTSL 213.9□□□□□ -0.181e-15■■■■■ 42
EFTUD2Q15029 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.982e-44■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 HEMGN-201ENST00000259456 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.096e-11■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.556e-11■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 KATNB1-209ENST00000569018 668 ntTSL 217.85■□□□□ 0.458e-7■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 KATNB1-205ENST00000563462 827 ntTSL 512.61□□□□□ -0.398e-7■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 HGS-215ENST00000576393 922 ntTSL 219.41■□□□□ 0.73e-7■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PLXNB2-209ENST00000479701 3504 ntTSL 213.81□□□□□ -0.23e-7■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.584e-8■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.133e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.963e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.961e-8■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.913e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.894e-8■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.873e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.863e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 HLA-C-207ENST00000484378 862 nt26.48■■□□□ 1.833e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.83e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.783e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.763e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 KLHL42-202ENST00000539176 1894 ntTSL 326.03■■□□□ 1.763e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.754e-8■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 KCTD5-203ENST00000564246 615 ntTSL 325.74■■□□□ 1.713e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.692e-7■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.673e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.634e-8■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.624e-8■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.613e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 POLR3H-207ENST00000432789 1598 ntTSL 224.96■■□□□ 1.593e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.552e-11■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 KIAA1211-207ENST00000629263 830 ntAPPRIS ALT2 TSL 524.39■■□□□ 1.493e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.483e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.483e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CERCAM-203ENST00000411852 1176 ntTSL 524.14■■□□□ 1.453e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ITPK1-203ENST00000553452 609 ntTSL 524.12■■□□□ 1.453e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.453e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.443e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.442e-11■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.43e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.394e-8■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.374e-8■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 HLA-C-204ENST00000415537 782 nt23.4■■□□□ 1.343e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.317e-8■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.33e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.32e-11■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.31e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.294e-8■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CU639417.2-202ENST00000624077 471 ntTSL 223.05■■□□□ 1.283e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 POLR2F-206ENST00000443002 1890 ntTSL 223.04■■□□□ 1.283e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SGSM2-205ENST00000572875 460 ntTSL 323■■□□□ 1.273e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.263e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 GMFB-203ENST00000553566 391 ntTSL 522.91■■□□□ 1.263e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.252e-11■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.243e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.223e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 HLA-C-209ENST00000495835 1073 nt22.69■■□□□ 1.223e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.57■■□□□ 1.23e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RNF38-208ENST00000488058 582 ntTSL 322.53■■□□□ 1.23e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.193e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 KCTD5-205ENST00000570005 486 ntTSL 322.51■■□□□ 1.193e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.193e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ZBTB17-209ENST00000474511 794 ntTSL 322.45■■□□□ 1.183e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.183e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.183e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.143e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.113e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ELAC2-218ENST00000584650 2087 ntTSL 221.95■■□□□ 1.111e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ARPC1B-218ENST00000484375 785 ntTSL 321.94■■□□□ 1.13e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 BRF1-216ENST00000550208 1040 ntTSL 321.86■■□□□ 1.093e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.093e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NUP50-211ENST00000445721 443 ntTSL 521.81■■□□□ 1.082e-11■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.072e-11■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 GUK1-220ENST00000471270 657 ntTSL 221.75■■□□□ 1.073e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.072e-11■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ZNF664-208ENST00000540009 753 ntTSL 321.73■■□□□ 1.073e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MTMR14-210ENST00000447144 1664 ntTSL 221.72■■□□□ 1.071e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ARMC6-211ENST00000538663 552 ntTSL 421.66■■□□□ 1.063e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.053e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.053e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.052e-7■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.053e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.053e-6■■■■■ 41.9
Retrieved 100 of 48,698 protein–RNA pairs in 1742.2 ms