Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms