Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJA9P57773 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJA9P57773 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJA9P57773 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJA9P57773 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJA9P57773 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJA9P57773 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJA9P57773 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJA9P57773 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJA9P57773 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJA9P57773 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJA9P57773 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA9P57773 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA9P57773 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA9P57773 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA9P57773 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA9P57773 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA9P57773 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA9P57773 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA9P57773 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA9P57773 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA9P57773 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA9P57773 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA9P57773 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA9P57773 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA9P57773 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA9P57773 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA9P57773 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA9P57773 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA9P57773 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA9P57773 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA9P57773 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA9P57773 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA9P57773 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA9P57773 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA9P57773 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA9P57773 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA9P57773 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA9P57773 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA9P57773 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA9P57773 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA9P57773 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA9P57773 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA9P57773 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA9P57773 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA9P57773 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA9P57773 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA9P57773 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA9P57773 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA9P57773 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA9P57773 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA9P57773 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA9P57773 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA9P57773 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA9P57773 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA9P57773 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA9P57773 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA9P57773 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA9P57773 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA9P57773 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA9P57773 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA9P57773 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA9P57773 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA9P57773 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA9P57773 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA9P57773 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA9P57773 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA9P57773 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA9P57773 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA9P57773 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA9P57773 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA9P57773 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA9P57773 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA9P57773 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA9P57773 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA9P57773 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA9P57773 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA9P57773 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA9P57773 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA9P57773 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA9P57773 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA9P57773 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA9P57773 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJA9P57773 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJA9P57773 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJA9P57773 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJA9P57773 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJA9P57773 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GJA9P57773 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJA9P57773 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJA9P57773 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJA9P57773 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJA9P57773 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJA9P57773 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJA9P57773 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GJA9P57773 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GJA9P57773 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GJA9P57773 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA9P57773 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA9P57773 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms