Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 ACP1-203ENST00000405233 1149 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.138e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 SDC2-208ENST00000523877 621 ntTSL 56.81□□□□□ -1.325e-9■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.675e-9■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 SDC2-206ENST00000521590 507 ntTSL 44.57□□□□□ -1.685e-9■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 ZC3H11A-206ENST00000453771 1892 ntTSL 510.06□□□□□ -0.89e-10■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 ZC3H11A-203ENST00000367212 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.219e-10■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.339e-10■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.389e-10■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.439e-10■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.69e-10■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 ZC3H11A-213ENST00000638800 7078 ntTSL 55.05□□□□□ -1.69e-10■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.619e-10■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 ZC3H11A-212ENST00000495527 8404 ntTSL 1 (best)4.77□□□□□ -1.659e-10■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 ZC3H11A-215ENST00000640465 4365 ntTSL 1 (best)4.26□□□□□ -1.739e-10■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.739e-10■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 LRBA-202ENST00000502839 814 ntTSL 36.32□□□□□ -1.47e-9■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 PLK4-209ENST00000513090 3123 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.425e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 PLK4-203ENST00000507249 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.485e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 PLK4-210ENST00000514379 3060 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.515e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 PLK4-211ENST00000515069 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.625e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 PLK4-201ENST00000270861 3841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.655e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 PLK4-204ENST00000507454 632 ntTSL 23.54□□□□□ -1.845e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 KCNH2-204ENST00000461280 2430 ntTSL 1 (best)18.3■□□□□ 0.522e-6■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 KCNH2-205ENST00000473610 2782 ntTSL 217.69■□□□□ 0.422e-6■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 BET1L-205ENST00000479463 684 ntTSL 319.44■□□□□ 0.71e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 GART-208ENST00000430874 1036 ntTSL 519.2■□□□□ 0.661e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.621e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 TSTA3-213ENST00000531006 860 ntTSL 218.59■□□□□ 0.571e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.551e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.491e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.431e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.431e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 BABAM1-218ENST00000602066 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)17.54■□□□□ 0.41e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 BABAM1-207ENST00000596335 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 317.14■□□□□ 0.331e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 BABAM1-216ENST00000601436 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 317.14■□□□□ 0.331e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.321e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.31e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 TSTA3-211ENST00000529899 568 ntTSL 216.87■□□□□ 0.291e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.281e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.251e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.171e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.121e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 MRPL3-209ENST00000511168 1377 ntTSL 215.8■□□□□ 0.121e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.11e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 BABAM1-205ENST00000595393 1471 ntTSL 214.38□□□□□ -0.111e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 BABAM1-214ENST00000601171 513 ntTSL 514.23□□□□□ -0.131e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.211e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 BIRC5-206ENST00000589892 747 ntTSL 213.49□□□□□ -0.251e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 MRPL3-205ENST00000507669 848 ntTSL 312.74□□□□□ -0.371e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 BABAM1-204ENST00000594247 1004 ntTSL 511.9□□□□□ -0.51e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 BABAM1-211ENST00000599057 634 ntAPPRIS ALT2 TSL 511.9□□□□□ -0.51e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 BABAM1-203ENST00000448635 589 ntTSL 311.53□□□□□ -0.561e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 ISCU-210ENST00000544493 543 ntTSL 311□□□□□ -0.651e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 RSRC2-209ENST00000525570 553 ntTSL 49.94□□□□□ -0.821e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 EHMT2-207ENST00000463484 547 ntTSL 49.93□□□□□ -0.821e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 BABAM1-212ENST00000599474 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 29.85□□□□□ -0.831e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 BABAM1-217ENST00000601938 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 59.85□□□□□ -0.831e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 MIR636-201ENST00000384825 99 ntBASIC8.8□□□□□ -15e-21■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 GART-214ENST00000476524 806 ntTSL 28.21□□□□□ -1.11e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 GART-207ENST00000426819 837 ntTSL 57.1□□□□□ -1.271e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 GART-218ENST00000497313 457 ntTSL 37.04□□□□□ -1.281e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 GART-217ENST00000488791 778 ntTSL 36.19□□□□□ -1.421e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 MRPL3-206ENST00000510043 640 ntTSL 23.64□□□□□ -1.831e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 FLVCR1-205ENST00000579295 479 ntTSL 33.38□□□□□ -1.871e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 SMC4-203ENST00000462668 4235 ntTSL 22.56□□□□□ -21e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.65e-6■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 CNOT11-203ENST00000462489 572 ntTSL 22.78□□□□□ -1.965e-6■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 CYBRD1-207ENST00000494587 549 ntTSL 416.12■□□□□ 0.171e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 LMBR1L-212ENST00000549587 545 ntTSL 28.98□□□□□ -0.971e-7■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.424e-8■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 SNAP23-219ENST00000568745 814 ntTSL 53.09□□□□□ -1.914e-8■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 NDUFV2-203ENST00000465096 643 ntTSL 24.74□□□□□ -1.656e-8■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 AC241952.1-201ENST00000612480 6897 ntBASIC11.18□□□□□ -0.622e-8■□□□□ 9.6
SF3B4Q15427 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.062e-7■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 MAGOH-203ENST00000462941 738 ntTSL 210.22□□□□□ -0.773e-8■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 IMPDH1-206ENST00000468842 587 ntTSL 39.83□□□□□ -0.843e-6■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 ARL8B-203ENST00000429403 709 ntTSL 517.08■□□□□ 0.321e-10■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 ARL8B-204ENST00000444332 732 ntTSL 217.08■□□□□ 0.321e-10■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.733e-16■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 HSPA8-211ENST00000527983 1509 ntTSL 1 (best)10.28□□□□□ -0.761e-323■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 HSPA8-209ENST00000526862 504 ntTSL 34.06□□□□□ -1.761e-323■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.441e-323■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 MAP3K4-210ENST00000540205 589 ntTSL 412.26□□□□□ -0.454e-7■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 YWHAZ-221ENST00000523131 567 ntTSL 518.82■□□□□ 0.62e-8■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 YWHAZ-208ENST00000418997 996 ntTSL 218.34■□□□□ 0.532e-8■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 YWHAZ-223ENST00000523938 626 ntTSL 518.28■□□□□ 0.522e-8■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 YWHAZ-210ENST00000437293 701 ntTSL 317.37■□□□□ 0.372e-8■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 PPFIA1-210ENST00000528284 568 ntTSL 415.82■□□□□ 0.123e-6■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 PPFIA1-207ENST00000526347 862 ntTSL 510.5□□□□□ -0.733e-6■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 PPFIA1-211ENST00000528750 1168 ntTSL 58.22□□□□□ -1.093e-6■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 PPFIA1-213ENST00000530294 977 ntTSL 58.11□□□□□ -1.113e-6■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 PPFIA1-205ENST00000526074 573 ntTSL 34.51□□□□□ -1.693e-6■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 PPFIA1-224ENST00000533894 553 ntTSL 43.38□□□□□ -1.873e-6■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 SLC16A3-216ENST00000583025 955 ntTSL 217.54■□□□□ 0.41e-13■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 CS-226ENST00000551430 751 ntTSL 318.85■□□□□ 0.615e-6■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 TAPT1-211ENST00000508888 837 ntTSL 312.65□□□□□ -0.385e-6■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 CS-231ENST00000552222 555 ntTSL 412.3□□□□□ -0.445e-6■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 TAPT1-212ENST00000510868 709 ntTSL 57.9□□□□□ -1.145e-6■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 TAPT1-214ENST00000511866 577 ntTSL 57.72□□□□□ -1.175e-6■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 TAPT1-215ENST00000513359 749 ntTSL 57.46□□□□□ -1.225e-6■□□□□ 9.5
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