RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531006.1

TSTA3-213, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 2

Gene TSTA3, Length 860 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-213ENST00000531006 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.27■■■■■ 5.64
TSTA3-213ENST00000531006 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.72■■■■■ 4.75
TSTA3-213ENST00000531006 ABCC9O60706 1549 aa44.23■■■■■ 4.67
TSTA3-213ENST00000531006 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.41■■■■■ 4.38
TSTA3-213ENST00000531006 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.27■■■■■ 4.36
TSTA3-213ENST00000531006 NACADO15069 1562 aa42.13■■■■■ 4.33
TSTA3-213ENST00000531006 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.77■■■■■ 4.28
TSTA3-213ENST00000531006 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.69■■■■■ 4.26
TSTA3-213ENST00000531006 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.45■■■■■ 4.23
TSTA3-213ENST00000531006 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.45■■■■■ 4.23
TSTA3-213ENST00000531006 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.39■■■■■ 4.22
TSTA3-213ENST00000531006 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.08■■■■■ 4.17
TSTA3-213ENST00000531006 SCRIBQ14160 1630 aa40.96■■■■■ 4.15
TSTA3-213ENST00000531006 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.95■■■■■ 4.15
TSTA3-213ENST00000531006 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.36■■■■■ 4.05
TSTA3-213ENST00000531006 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.98■■■■□ 3.99
TSTA3-213ENST00000531006 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.94■■■■□ 3.98
TSTA3-213ENST00000531006 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.7■■■■□ 3.95
TSTA3-213ENST00000531006 SMARCA4P51532 1647 aa39.07■■■■□ 3.85
TSTA3-213ENST00000531006 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.94■■■■□ 3.82
TSTA3-213ENST00000531006 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.93■■■■□ 3.82
TSTA3-213ENST00000531006 NCAPD3P42695 1498 aa38.91■■■■□ 3.82
TSTA3-213ENST00000531006 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.82■■■■□ 3.8
TSTA3-213ENST00000531006 SMARCA2P51531 1590 aa38.81■■■■□ 3.8
TSTA3-213ENST00000531006 HMGXB3Q12766 1538 aa38.63■■■■□ 3.78
TSTA3-213ENST00000531006 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.6■■■■□ 3.77
TSTA3-213ENST00000531006 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.6■■■■□ 3.77
TSTA3-213ENST00000531006 WIZO95785 1651 aa38.42■■■■□ 3.74
TSTA3-213ENST00000531006 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.25■■■■□ 3.71
TSTA3-213ENST00000531006 NESP48681 1621 aa38.21■■■■□ 3.71
TSTA3-213ENST00000531006 ERCC6Q03468 1493 aa38.09■■■■□ 3.69
TSTA3-213ENST00000531006 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.9■■■■□ 3.66
TSTA3-213ENST00000531006 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.87■■■■□ 3.65
TSTA3-213ENST00000531006 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.8■■■■□ 3.64
TSTA3-213ENST00000531006 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.72■■■■□ 3.63
TSTA3-213ENST00000531006 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.69■■■■□ 3.62
TSTA3-213ENST00000531006 CUX2O14529 1486 aa37.66■■■■□ 3.62
TSTA3-213ENST00000531006 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.55■■■■□ 3.6
TSTA3-213ENST00000531006 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.52■■■■□ 3.6
TSTA3-213ENST00000531006 CFTRP13569 1480 aa37.49■■■■□ 3.59
TSTA3-213ENST00000531006 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.39■■■■□ 3.58
TSTA3-213ENST00000531006 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.33■■■■□ 3.57
TSTA3-213ENST00000531006 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.33■■■■□ 3.57
TSTA3-213ENST00000531006 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.28■■■■□ 3.56
TSTA3-213ENST00000531006 PRDM2Q13029 1718 aa37.19■■■■□ 3.54
TSTA3-213ENST00000531006 WDR62O43379 1518 aa37.18■■■■□ 3.54
TSTA3-213ENST00000531006 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.05■■■■□ 3.52
TSTA3-213ENST00000531006 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.97■■■■□ 3.51
TSTA3-213ENST00000531006 TOPBP1Q92547 1522 aa36.76■■■■□ 3.48
TSTA3-213ENST00000531006 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.65■■■■□ 3.46
TSTA3-213ENST00000531006 ABCC8Q09428 1581 aa36.64■■■■□ 3.46
TSTA3-213ENST00000531006 IFT140Q96RY7 1462 aa36.54■■■■□ 3.44
TSTA3-213ENST00000531006 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.52■■■■□ 3.44
TSTA3-213ENST00000531006 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.42■■■■□ 3.42
TSTA3-213ENST00000531006 CUX1P39880 1505 aa36.41■■■■□ 3.42
TSTA3-213ENST00000531006 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.37■■■■□ 3.41
TSTA3-213ENST00000531006 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.37■■■■□ 3.41
TSTA3-213ENST00000531006 SOGA1O94964 1423 aa36.32■■■■□ 3.4
TSTA3-213ENST00000531006 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.31■■■■□ 3.4
TSTA3-213ENST00000531006 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.31■■■■□ 3.44e-8■■■■■ 34.1
TSTA3-213ENST00000531006 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.28■■■■□ 3.4
TSTA3-213ENST00000531006 OSCARQ8IYS5 282 aa36.21■■■■□ 3.39
TSTA3-213ENST00000531006 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.2■■■■□ 3.39
TSTA3-213ENST00000531006 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.05■■■■□ 3.36
TSTA3-213ENST00000531006 SYNJ1O43426 1573 aa36.01■■■■□ 3.35
TSTA3-213ENST00000531006 FBLN2P98095 1184 aa36■■■■□ 3.35
TSTA3-213ENST00000531006 WDR97A6NE52 1622 aa35.97■■■■□ 3.35
TSTA3-213ENST00000531006 TOP2BQ02880 1626 aa35.97■■■■□ 3.35
TSTA3-213ENST00000531006 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.96■■■■□ 3.35
TSTA3-213ENST00000531006 CHD1O14646 1710 aa35.94■■■■□ 3.34
TSTA3-213ENST00000531006 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.89■■■■□ 3.34
TSTA3-213ENST00000531006 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.89■■■■□ 3.34
TSTA3-213ENST00000531006 GRIN2BQ13224 1484 aa35.86■■■■□ 3.33
TSTA3-213ENST00000531006 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.86■■■■□ 3.33
TSTA3-213ENST00000531006 PBRM1Q86U86 1689 aa35.81■■■■□ 3.32
TSTA3-213ENST00000531006 TRIM41Q8WV44 630 aa35.79■■■■□ 3.32
TSTA3-213ENST00000531006 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.77■■■■□ 3.32
TSTA3-213ENST00000531006 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.77■■■■□ 3.32
TSTA3-213ENST00000531006 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.74■■■■□ 3.31
TSTA3-213ENST00000531006 SYNJ2O15056 1496 aa35.64■■■■□ 3.3
TSTA3-213ENST00000531006 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.64■■■■□ 3.3
TSTA3-213ENST00000531006 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.64■■■■□ 3.3
TSTA3-213ENST00000531006 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.64■■■■□ 3.3
TSTA3-213ENST00000531006 ARHGEF11O15085 1522 aa35.56■■■■□ 3.28
TSTA3-213ENST00000531006 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.45■■■■□ 3.27
TSTA3-213ENST00000531006 ADAMTS12P58397 1594 aa35.45■■■■□ 3.27
TSTA3-213ENST00000531006 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.43■■■■□ 3.26
TSTA3-213ENST00000531006 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.4■■■■□ 3.26
TSTA3-213ENST00000531006 GRIN2AQ12879 1464 aa35.4■■■■□ 3.26
TSTA3-213ENST00000531006 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.4■■■■□ 3.26
TSTA3-213ENST00000531006 KIF27Q86VH2 1401 aa35.3■■■■□ 3.24
TSTA3-213ENST00000531006 CEP170Q5SW79 1584 aa35.27■■■■□ 3.24
TSTA3-213ENST00000531006 ARAP1Q96P48 1450 aa35.27■■■■□ 3.24
TSTA3-213ENST00000531006 IGF1RP08069 1367 aa35.25■■■■□ 3.23
TSTA3-213ENST00000531006 NUP160Q12769 1436 aa35.23■■■■□ 3.23
TSTA3-213ENST00000531006 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.08■■■■□ 3.21
TSTA3-213ENST00000531006 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.06■■■■□ 3.2
TSTA3-213ENST00000531006 CUL7Q14999 1698 aa35.06■■■■□ 3.2
TSTA3-213ENST00000531006 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.03■■■■□ 3.2
TSTA3-213ENST00000531006 JPH4Q96JJ6 628 aa35■■■■□ 3.19
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