Protein–RNA interactions for Protein: Q9H040

SPRTN, SprT-like domain-containing protein Spartan, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRTNQ9H040 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPRTNQ9H040 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SPRTNQ9H040 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPRTNQ9H040 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPRTNQ9H040 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPRTNQ9H040 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPRTNQ9H040 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPRTNQ9H040 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPRTNQ9H040 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPRTNQ9H040 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPRTNQ9H040 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPRTNQ9H040 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPRTNQ9H040 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPRTNQ9H040 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPRTNQ9H040 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPRTNQ9H040 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPRTNQ9H040 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPRTNQ9H040 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPRTNQ9H040 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPRTNQ9H040 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPRTNQ9H040 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPRTNQ9H040 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPRTNQ9H040 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPRTNQ9H040 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPRTNQ9H040 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPRTNQ9H040 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPRTNQ9H040 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPRTNQ9H040 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPRTNQ9H040 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPRTNQ9H040 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPRTNQ9H040 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPRTNQ9H040 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPRTNQ9H040 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPRTNQ9H040 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPRTNQ9H040 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPRTNQ9H040 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPRTNQ9H040 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms