Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GINS3Q9BRX5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GINS3Q9BRX5 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms