Protein–RNA interactions for Protein: Q96M42

LINC00479, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00479, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00479Q96M42 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00479Q96M42 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00479Q96M42 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00479Q96M42 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00479Q96M42 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00479Q96M42 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00479Q96M42 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00479Q96M42 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00479Q96M42 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00479Q96M42 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00479Q96M42 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00479Q96M42 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00479Q96M42 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00479Q96M42 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00479Q96M42 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00479Q96M42 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00479Q96M42 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00479Q96M42 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00479Q96M42 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00479Q96M42 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00479Q96M42 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00479Q96M42 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00479Q96M42 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00479Q96M42 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00479Q96M42 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00479Q96M42 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00479Q96M42 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00479Q96M42 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00479Q96M42 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LINC00479Q96M42 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00479Q96M42 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms