Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMO3Q8TAP4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMO3Q8TAP4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMO3Q8TAP4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms