Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPT2

FAM71E1, Protein FAM71E1, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71E1Q6IPT2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM71E1Q6IPT2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM71E1Q6IPT2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM71E1Q6IPT2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM71E1Q6IPT2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM71E1Q6IPT2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms