Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTK7Q13308 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTK7Q13308 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTK7Q13308 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTK7Q13308 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTK7Q13308 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTK7Q13308 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTK7Q13308 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTK7Q13308 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTK7Q13308 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTK7Q13308 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTK7Q13308 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTK7Q13308 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTK7Q13308 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTK7Q13308 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTK7Q13308 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTK7Q13308 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTK7Q13308 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTK7Q13308 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTK7Q13308 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
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