Protein–RNA interactions for Protein: P56559

ARL4C, ADP-ribosylation factor-like protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4CP56559 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARL4CP56559 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARL4CP56559 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARL4CP56559 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARL4CP56559 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARL4CP56559 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ARL4CP56559 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARL4CP56559 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARL4CP56559 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARL4CP56559 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARL4CP56559 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARL4CP56559 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARL4CP56559 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARL4CP56559 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARL4CP56559 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARL4CP56559 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARL4CP56559 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARL4CP56559 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARL4CP56559 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ARL4CP56559 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARL4CP56559 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARL4CP56559 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARL4CP56559 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARL4CP56559 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARL4CP56559 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARL4CP56559 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARL4CP56559 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARL4CP56559 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARL4CP56559 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARL4CP56559 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ARL4CP56559 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARL4CP56559 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARL4CP56559 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms