Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT9P35527 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT9P35527 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT9P35527 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT9P35527 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT9P35527 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT9P35527 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT9P35527 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT9P35527 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT9P35527 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT9P35527 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT9P35527 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT9P35527 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT9P35527 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT9P35527 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT9P35527 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT9P35527 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT9P35527 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT9P35527 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT9P35527 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT9P35527 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT9P35527 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT9P35527 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT9P35527 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT9P35527 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT9P35527 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT9P35527 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT9P35527 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT9P35527 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT9P35527 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT9P35527 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT9P35527 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT9P35527 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT9P35527 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT9P35527 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT9P35527 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT9P35527 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT9P35527 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT9P35527 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT9P35527 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT9P35527 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT9P35527 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT9P35527 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT9P35527 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT9P35527 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT9P35527 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT9P35527 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT9P35527 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT9P35527 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT9P35527 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT9P35527 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT9P35527 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT9P35527 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT9P35527 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT9P35527 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT9P35527 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT9P35527 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT9P35527 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT9P35527 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT9P35527 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT9P35527 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT9P35527 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT9P35527 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT9P35527 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT9P35527 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT9P35527 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT9P35527 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT9P35527 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT9P35527 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT9P35527 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT9P35527 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT9P35527 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT9P35527 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT9P35527 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT9P35527 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT9P35527 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT9P35527 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT9P35527 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT9P35527 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT9P35527 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT9P35527 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT9P35527 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT9P35527 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT9P35527 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT9P35527 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT9P35527 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT9P35527 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT9P35527 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT9P35527 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT9P35527 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT9P35527 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT9P35527 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT9P35527 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT9P35527 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT9P35527 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT9P35527 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT9P35527 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT9P35527 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT9P35527 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT9P35527 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms