Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMLP26374 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMLP26374 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMLP26374 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMLP26374 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMLP26374 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMLP26374 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMLP26374 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMLP26374 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMLP26374 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMLP26374 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMLP26374 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMLP26374 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMLP26374 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMLP26374 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMLP26374 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMLP26374 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMLP26374 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMLP26374 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMLP26374 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMLP26374 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMLP26374 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHMLP26374 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHMLP26374 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHMLP26374 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHMLP26374 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHMLP26374 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CHMLP26374 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHMLP26374 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHMLP26374 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHMLP26374 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CHMLP26374 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHMLP26374 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHMLP26374 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHMLP26374 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHMLP26374 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHMLP26374 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHMLP26374 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHMLP26374 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMLP26374 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMLP26374 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMLP26374 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMLP26374 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMLP26374 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMLP26374 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMLP26374 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMLP26374 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMLP26374 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMLP26374 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMLP26374 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHMLP26374 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHMLP26374 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHMLP26374 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHMLP26374 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHMLP26374 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CHMLP26374 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHMLP26374 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHMLP26374 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHMLP26374 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHMLP26374 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHMLP26374 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHMLP26374 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHMLP26374 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMLP26374 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMLP26374 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMLP26374 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMLP26374 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMLP26374 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMLP26374 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMLP26374 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMLP26374 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMLP26374 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMLP26374 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMLP26374 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMLP26374 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMLP26374 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMLP26374 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMLP26374 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMLP26374 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMLP26374 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMLP26374 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMLP26374 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMLP26374 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMLP26374 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMLP26374 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMLP26374 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHMLP26374 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHMLP26374 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHMLP26374 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHMLP26374 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHMLP26374 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHMLP26374 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHMLP26374 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHMLP26374 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHMLP26374 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHMLP26374 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHMLP26374 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHMLP26374 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMLP26374 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMLP26374 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms