Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTF3P20783 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTF3P20783 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTF3P20783 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTF3P20783 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTF3P20783 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTF3P20783 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTF3P20783 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTF3P20783 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTF3P20783 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTF3P20783 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTF3P20783 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTF3P20783 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTF3P20783 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTF3P20783 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTF3P20783 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NTF3P20783 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTF3P20783 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTF3P20783 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NTF3P20783 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTF3P20783 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTF3P20783 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF3P20783 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF3P20783 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF3P20783 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF3P20783 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF3P20783 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF3P20783 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF3P20783 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF3P20783 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF3P20783 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF3P20783 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF3P20783 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF3P20783 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF3P20783 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF3P20783 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF3P20783 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF3P20783 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF3P20783 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF3P20783 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF3P20783 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF3P20783 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF3P20783 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF3P20783 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF3P20783 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF3P20783 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF3P20783 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF3P20783 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF3P20783 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF3P20783 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF3P20783 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF3P20783 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF3P20783 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF3P20783 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF3P20783 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF3P20783 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF3P20783 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF3P20783 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF3P20783 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF3P20783 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF3P20783 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF3P20783 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF3P20783 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF3P20783 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF3P20783 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF3P20783 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF3P20783 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF3P20783 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF3P20783 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF3P20783 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF3P20783 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF3P20783 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF3P20783 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF3P20783 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF3P20783 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF3P20783 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF3P20783 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTF3P20783 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTF3P20783 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTF3P20783 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTF3P20783 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTF3P20783 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTF3P20783 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTF3P20783 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTF3P20783 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTF3P20783 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTF3P20783 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTF3P20783 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NTF3P20783 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NTF3P20783 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTF3P20783 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTF3P20783 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NTF3P20783 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NTF3P20783 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NTF3P20783 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NTF3P20783 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NTF3P20783 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NTF3P20783 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NTF3P20783 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NTF3P20783 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms