Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GABARAPO95166 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABARAPO95166 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms