Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RHOBTB3O94955 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms