Protein–RNA interactions for Protein: O43818

RRP9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9O43818 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RRP9O43818 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRP9O43818 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRP9O43818 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRP9O43818 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRP9O43818 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRP9O43818 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRP9O43818 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRP9O43818 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRP9O43818 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRP9O43818 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRP9O43818 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRP9O43818 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRP9O43818 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRP9O43818 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRP9O43818 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRP9O43818 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRP9O43818 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRP9O43818 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRP9O43818 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRP9O43818 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRP9O43818 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRP9O43818 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRP9O43818 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRP9O43818 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRP9O43818 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRP9O43818 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRP9O43818 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRP9O43818 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRP9O43818 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRP9O43818 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRP9O43818 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRP9O43818 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRP9O43818 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRP9O43818 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRP9O43818 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRP9O43818 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRP9O43818 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRP9O43818 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRP9O43818 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRP9O43818 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RRP9O43818 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RRP9O43818 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRP9O43818 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRP9O43818 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRP9O43818 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRP9O43818 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRP9O43818 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRP9O43818 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRP9O43818 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRP9O43818 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRP9O43818 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRP9O43818 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRP9O43818 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRP9O43818 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRP9O43818 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRP9O43818 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RRP9O43818 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRP9O43818 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRP9O43818 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRP9O43818 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRP9O43818 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRP9O43818 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRP9O43818 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRP9O43818 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRP9O43818 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRP9O43818 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRP9O43818 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRP9O43818 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRP9O43818 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRP9O43818 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRP9O43818 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRP9O43818 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRP9O43818 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRP9O43818 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRP9O43818 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRP9O43818 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRP9O43818 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRP9O43818 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRP9O43818 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRP9O43818 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRP9O43818 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRP9O43818 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRP9O43818 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRP9O43818 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRP9O43818 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRP9O43818 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRP9O43818 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRP9O43818 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRP9O43818 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRP9O43818 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRP9O43818 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRP9O43818 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRP9O43818 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRP9O43818 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RRP9O43818 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRP9O43818 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRP9O43818 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRP9O43818 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRP9O43818 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms