Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 SYPL1-202ENST00000455385 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.553e-6■■■■■ 40.4
UTP3Q9NQZ2 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.943e-6■■■■■ 40.4
UTP3Q9NQZ2 CSNK2A1-208ENST00000609525 581 ntTSL 58.9□□□□□ -0.983e-6■■■■■ 40.4
UTP3Q9NQZ2 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.243e-6■■■■■ 40.4
UTP3Q9NQZ2 SYPL1-207ENST00000634737 835 ntTSL 57.13□□□□□ -1.273e-6■■■■■ 40.4
UTP3Q9NQZ2 RNF115-201ENST00000539368 3097 ntTSL 1 (best)6.14□□□□□ -1.433e-6■■■■■ 40.4
UTP3Q9NQZ2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.87e-7■■■■■ 40.4
UTP3Q9NQZ2 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.297e-7■■■■■ 40.4
UTP3Q9NQZ2 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.117e-7■■■■■ 40.4
UTP3Q9NQZ2 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.077e-7■■■■■ 40.4
UTP3Q9NQZ2 LRIF1-201ENST00000369763 3475 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.497e-7■■■■■ 40.4
UTP3Q9NQZ2 PSMD7-202ENST00000563150 724 ntTSL 210.14□□□□□ -0.791e-14■■■■■ 40.4
UTP3Q9NQZ2 HNRNPR-206ENST00000464516 557 ntTSL 28.52□□□□□ -1.057e-7■■■■■ 40.4
UTP3Q9NQZ2 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.627e-7■■■■■ 40.4
UTP3Q9NQZ2 SF3B2-209ENST00000530322 1163 ntTSL 517.99■□□□□ 0.471e-6■■■■■ 40.4
UTP3Q9NQZ2 SF3B2-214ENST00000533595 1081 ntTSL 515.62■□□□□ 0.091e-6■■■■■ 40.4
UTP3Q9NQZ2 SF3B2-203ENST00000524627 841 ntTSL 313.44□□□□□ -0.261e-6■■■■■ 40.4
UTP3Q9NQZ2 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.184e-6■■■■■ 40.3
UTP3Q9NQZ2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.934e-8■■■■■ 40.3
UTP3Q9NQZ2 SHF-211ENST00000561278 578 ntTSL 413.31□□□□□ -0.284e-8■■■■■ 40.3
UTP3Q9NQZ2 PNCK-227ENST00000475172 877 ntTSL 526.29■■□□□ 1.82e-6■■■■■ 40.3
UTP3Q9NQZ2 PNCK-220ENST00000465303 868 ntTSL 419.65■□□□□ 0.742e-6■■■■■ 40.3
UTP3Q9NQZ2 PNCK-230ENST00000488168 976 ntTSL 318.64■□□□□ 0.572e-6■■■■■ 40.3
UTP3Q9NQZ2 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 40.3
UTP3Q9NQZ2 SF3B2-201ENST00000322535 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.532e-6■■■■■ 40.3
UTP3Q9NQZ2 SF3B2-206ENST00000528302 3254 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.662e-6■■■■■ 40.3
UTP3Q9NQZ2 RHOT2-204ENST00000561983 1044 ntTSL 526.01■■□□□ 1.751e-9■■■■■ 40.2
UTP3Q9NQZ2 RHOT2-226ENST00000570280 708 ntTSL 321.81■■□□□ 1.081e-9■■■■■ 40.2
UTP3Q9NQZ2 RHOT2-211ENST00000563776 923 ntTSL 319.19■□□□□ 0.661e-9■■■■■ 40.2
UTP3Q9NQZ2 PCBP2-226ENST00000562264 1145 ntTSL 511.74□□□□□ -0.532e-6■■■■■ 40.2
UTP3Q9NQZ2 PHF3-201ENST00000262043 8233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.454e-6■■■■■ 40.2
UTP3Q9NQZ2 PHF3-210ENST00000509876 7124 ntTSL 1 (best)5.81□□□□□ -1.484e-6■■■■■ 40.2
UTP3Q9NQZ2 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.764e-6■■■■■ 40.2
UTP3Q9NQZ2 DAP3-217ENST00000477394 816 ntTSL 59.87□□□□□ -0.832e-6■■■■■ 40.2
UTP3Q9NQZ2 DAP3-220ENST00000490249 710 ntTSL 36.59□□□□□ -1.352e-6■■■■■ 40.2
UTP3Q9NQZ2 DAP3-215ENST00000475056 682 ntTSL 34.94□□□□□ -1.622e-6■■■■■ 40.2
UTP3Q9NQZ2 HNRNPH1-242ENST00000522256 492 ntTSL 416.26■□□□□ 0.196e-7■■■■■ 40.2
UTP3Q9NQZ2 SPAG9-204ENST00000505173 2369 ntTSL 57.86□□□□□ -1.154e-6■■■■■ 40.2
UTP3Q9NQZ2 SPAG9-219ENST00000514613 2523 ntTSL 27.68□□□□□ -1.184e-6■■■■■ 40.2
UTP3Q9NQZ2 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.224e-6■■■■■ 40.2
UTP3Q9NQZ2 FLNC-203ENST00000388853 570 ntTSL 217.02■□□□□ 0.322e-6■■■■■ 40.1
UTP3Q9NQZ2 SARS-203ENST00000468588 1582 ntTSL 26.35□□□□□ -1.391e-15■■■■■ 40.1
UTP3Q9NQZ2 KLC1-211ENST00000538504 822 ntTSL 224.64■■□□□ 1.547e-7■■■■■ 40.1
UTP3Q9NQZ2 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.067e-7■■■■■ 40.1
UTP3Q9NQZ2 RBM25-209ENST00000531500 1039 ntTSL 311.89□□□□□ -0.517e-7■■■■■ 40.1
UTP3Q9NQZ2 RBM25-203ENST00000525321 2470 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.547e-7■■■■■ 40.1
UTP3Q9NQZ2 TRMT2A-212ENST00000471040 848 ntTSL 318.04■□□□□ 0.489e-7■■■■■ 40.1
UTP3Q9NQZ2 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.463e-7■■■■■ 40.1
UTP3Q9NQZ2 ANP32E-210ENST00000629042 3054 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.263e-7■■■■■ 40.1
UTP3Q9NQZ2 ANP32E-203ENST00000436748 1339 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.633e-7■■■■■ 40.1
UTP3Q9NQZ2 ANP32E-208ENST00000583931 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.693e-7■■■■■ 40.1
UTP3Q9NQZ2 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.193e-7■■■■■ 40.1
UTP3Q9NQZ2 GPX4-208ENST00000592940 1184 ntTSL 524.01■■□□□ 1.431e-6■■■■■ 40.1
UTP3Q9NQZ2 CDV3-205ENST00000504867 471 ntTSL 319.03■□□□□ 0.647e-7■■■■■ 40.1
UTP3Q9NQZ2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.647e-7■■■■■ 40.1
UTP3Q9NQZ2 STAT6-218ENST00000555641 1804 ntTSL 517.93■□□□□ 0.467e-7■■■■■ 40.1
UTP3Q9NQZ2 GPX4-203ENST00000585480 501 ntTSL 215.92■□□□□ 0.141e-6■■■■■ 40.1
UTP3Q9NQZ2 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.67e-7■■■■■ 40.1
UTP3Q9NQZ2 CDV3-202ENST00000420115 3621 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.657e-7■■■■■ 40.1
UTP3Q9NQZ2 CDV3-209ENST00000515421 1305 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.697e-7■■■■■ 40.1
UTP3Q9NQZ2 GPX4-204ENST00000587648 536 ntTSL 29.65□□□□□ -0.861e-6■■■■■ 40.1
UTP3Q9NQZ2 CDV3-206ENST00000507408 448 ntTSL 27.22□□□□□ -1.257e-7■■■■■ 40.1
UTP3Q9NQZ2 ANKRD12-205ENST00000546007 978 ntTSL 56.3□□□□□ -1.41e-6■■■■■ 40.1
UTP3Q9NQZ2 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.427e-7■■■■■ 40.1
UTP3Q9NQZ2 YWHAZ-213ENST00000492736 681 ntTSL 322.76■■□□□ 1.235e-7■■■■■ 40
UTP3Q9NQZ2 ARHGAP19-201ENST00000358308 5390 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.499e-7■■■■■ 40
UTP3Q9NQZ2 ARHGAP19-202ENST00000358531 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.649e-7■■■■■ 40
UTP3Q9NQZ2 ARHGAP19-206ENST00000492211 5525 ntTSL 210.02□□□□□ -0.819e-7■■■■■ 40
UTP3Q9NQZ2 ARHGAP19-205ENST00000487035 4553 ntTSL 27.86□□□□□ -1.159e-7■■■■■ 40
UTP3Q9NQZ2 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.079e-7■■■■■ 40
UTP3Q9NQZ2 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.089e-7■■■■■ 40
UTP3Q9NQZ2 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.139e-7■■■■■ 40
UTP3Q9NQZ2 WNK1-219ENST00000545285 528 ntTSL 310.69□□□□□ -0.72e-6■■■■■ 40
UTP3Q9NQZ2 WNK1-217ENST00000544965 653 ntTSL 38.4□□□□□ -1.062e-6■■■■■ 40
UTP3Q9NQZ2 WNK1-207ENST00000535698 736 ntTSL 36.36□□□□□ -1.392e-6■■■■■ 40
UTP3Q9NQZ2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.022e-7■■■■■ 40
UTP3Q9NQZ2 UBE2O-202ENST00000586409 3579 ntTSL 216.61■□□□□ 0.252e-7■■■■■ 40
UTP3Q9NQZ2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.991e-6■■■■■ 39.9
UTP3Q9NQZ2 RBM14-RBM4-202ENST00000421355 2034 ntTSL 220.34■□□□□ 0.851e-6■■■■■ 39.9
UTP3Q9NQZ2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.71e-6■■■■■ 39.9
UTP3Q9NQZ2 SAFB-206ENST00000589006 459 ntTSL 521.12■□□□□ 0.974e-6■■■■■ 39.9
UTP3Q9NQZ2 MED15-221ENST00000473028 556 ntTSL 418.75■□□□□ 0.592e-6■■■■■ 39.9
UTP3Q9NQZ2 SRSF9-202ENST00000546942 946 ntTSL 1 (best)28.18■■■□□ 2.16e-10■■■■■ 39.9
UTP3Q9NQZ2 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.491e-6■■■■■ 39.8
UTP3Q9NQZ2 WIPI2-213ENST00000488359 602 ntTSL 39.59□□□□□ -0.871e-6■■■■■ 39.8
UTP3Q9NQZ2 SNORD3C-201ENST00000580533 581 ntBASIC12.54□□□□□ -0.41e-14■■■■■ 39.8
UTP3Q9NQZ2 SNORD3C-203ENST00000625845 217 nt11.89□□□□□ -0.511e-14■■■■■ 39.8
UTP3Q9NQZ2 SNORD3C-202ENST00000620446 218 nt11.77□□□□□ -0.531e-14■■■■■ 39.8
UTP3Q9NQZ2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.85■■□□□ 1.892e-44■■■■■ 39.8
UTP3Q9NQZ2 DANCR-203ENST00000441504 336 ntTSL 218.68■□□□□ 0.582e-44■■■■■ 39.8
UTP3Q9NQZ2 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.452e-44■■■■■ 39.8
UTP3Q9NQZ2 FAM117A-204ENST00000503855 582 ntTSL 312.57□□□□□ -0.47e-7■■■■■ 39.8
UTP3Q9NQZ2 MATR3-226ENST00000515833 1001 ntTSL 56.86□□□□□ -1.311e-17■■■■■ 39.7
UTP3Q9NQZ2 MATR3-210ENST00000504643 2560 ntTSL 28.26□□□□□ -1.095e-8■■■■■ 39.7
UTP3Q9NQZ2 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.091e-7■■■■■ 39.7
UTP3Q9NQZ2 KRIT1-205ENST00000412043 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.316e-6■■■■■ 39.7
UTP3Q9NQZ2 PITPNB-209ENST00000477861 786 ntTSL 59.09□□□□□ -0.956e-6■■■■■ 39.7
UTP3Q9NQZ2 AP2B1-214ENST00000614600 2285 ntTSL 512.64□□□□□ -0.392e-6■■■■■ 39.7
UTP3Q9NQZ2 AP2B1-220ENST00000621668 2055 ntTSL 512.02□□□□□ -0.482e-6■■■■■ 39.7
UTP3Q9NQZ2 AP2B1-212ENST00000612035 2161 ntTSL 510.69□□□□□ -0.72e-6■■■■■ 39.7
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