RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546942.1

SRSF9-202, Transcript of serine and arginine rich splicing factor 9, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SRSF9, Length 946 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF9-202ENST00000546942 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.09■■■■■ 8.01
SRSF9-202ENST00000546942 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa58.12■■■■■ 6.89
SRSF9-202ENST00000546942 ABCC9O60706 1549 aa57.66■■■■■ 6.82
SRSF9-202ENST00000546942 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.06■■■■■ 6.41
SRSF9-202ENST00000546942 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.93■■■■■ 6.38
SRSF9-202ENST00000546942 NACADO15069 1562 aa54.8■■■■■ 6.36
SRSF9-202ENST00000546942 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.14■■■■■ 6.26
SRSF9-202ENST00000546942 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.04■■■■■ 6.24
SRSF9-202ENST00000546942 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.9■■■■■ 6.22
SRSF9-202ENST00000546942 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.83■■■■■ 6.21
SRSF9-202ENST00000546942 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.71■■■■■ 6.19
SRSF9-202ENST00000546942 DNAJC5BQ9UF47 199 aa53.53■■■■■ 6.16
SRSF9-202ENST00000546942 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.43■■■■■ 6.14
SRSF9-202ENST00000546942 SCRIBQ14160 1630 aa53.13■■■■■ 6.1
SRSF9-202ENST00000546942 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.64■■■■■ 6.02
SRSF9-202ENST00000546942 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP52.08■■■■■ 5.93
SRSF9-202ENST00000546942 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa52.07■■■■■ 5.93
SRSF9-202ENST00000546942 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.82■■■■■ 5.89
SRSF9-202ENST00000546942 SMARCA4P51532 1647 aa50.67■■■■■ 5.7
SRSF9-202ENST00000546942 NCAPD3P42695 1498 aa50.57■■■■■ 5.69
SRSF9-202ENST00000546942 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.54■■■■■ 5.68
SRSF9-202ENST00000546942 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.48■■■■■ 5.67
SRSF9-202ENST00000546942 SMARCA2P51531 1590 aa50.43■■■■■ 5.66
SRSF9-202ENST00000546942 HMGXB3Q12766 1538 aa50.25■■■■■ 5.63
SRSF9-202ENST00000546942 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.2■■■■■ 5.63
SRSF9-202ENST00000546942 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.13■■■■■ 5.62
SRSF9-202ENST00000546942 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.09■■■■■ 5.61
SRSF9-202ENST00000546942 ERCC6Q03468 1493 aa49.74■■■■■ 5.55
SRSF9-202ENST00000546942 NESP48681 1621 aa49.7■■■■■ 5.55
SRSF9-202ENST00000546942 WIZO95785 1651 aa49.68■■■■■ 5.54
SRSF9-202ENST00000546942 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.37■■■■■ 5.49
SRSF9-202ENST00000546942 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.36■■■■■ 5.49
SRSF9-202ENST00000546942 CUX2O14529 1486 aa49.32■■■■■ 5.49
SRSF9-202ENST00000546942 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.11■■■■■ 5.45
SRSF9-202ENST00000546942 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.09■■■■■ 5.45
SRSF9-202ENST00000546942 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.09■■■■■ 5.45
SRSF9-202ENST00000546942 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.01■■■■■ 5.44
SRSF9-202ENST00000546942 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.99■■■■■ 5.43
SRSF9-202ENST00000546942 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa48.66■■■■■ 5.38
SRSF9-202ENST00000546942 CFTRP13569 1480 aa48.65■■■■■ 5.38
SRSF9-202ENST00000546942 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.62■■■■■ 5.37
SRSF9-202ENST00000546942 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.57■■■■■ 5.37
SRSF9-202ENST00000546942 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.57■■■■■ 5.37
SRSF9-202ENST00000546942 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.5■■■■■ 5.35
SRSF9-202ENST00000546942 WDR62O43379 1518 aa48.45■■■■■ 5.35
SRSF9-202ENST00000546942 PRDM2Q13029 1718 aa48.28■■■■■ 5.32
SRSF9-202ENST00000546942 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.13■■■■■ 5.3
SRSF9-202ENST00000546942 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.83■■■■■ 5.25
SRSF9-202ENST00000546942 TOPBP1Q92547 1522 aa47.71■■■■■ 5.23
SRSF9-202ENST00000546942 ABCC8Q09428 1581 aa47.62■■■■■ 5.21
SRSF9-202ENST00000546942 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.58■■■■■ 5.21
SRSF9-202ENST00000546942 IFT140Q96RY7 1462 aa47.54■■■■■ 5.2
SRSF9-202ENST00000546942 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.46■■■■■ 5.19
SRSF9-202ENST00000546942 OSCARQ8IYS5 282 aa47.28■■■■■ 5.16
SRSF9-202ENST00000546942 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.26■■■■■ 5.16
SRSF9-202ENST00000546942 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.23■■■■■ 5.15
SRSF9-202ENST00000546942 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.22■■■■■ 5.15
SRSF9-202ENST00000546942 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.14■■■■■ 5.14
SRSF9-202ENST00000546942 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.14■■■■■ 5.149e-20■■■■■ 33.5
SRSF9-202ENST00000546942 CUX1P39880 1505 aa47.13■■■■■ 5.14
SRSF9-202ENST00000546942 SOGA1O94964 1423 aa47.1■■■■■ 5.13
SRSF9-202ENST00000546942 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.08■■■■■ 5.13
SRSF9-202ENST00000546942 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.96■■■■■ 5.11
SRSF9-202ENST00000546942 TRIM41Q8WV44 630 aa46.95■■■■■ 5.11
SRSF9-202ENST00000546942 FBLN2P98095 1184 aa46.81■■■■■ 5.08
SRSF9-202ENST00000546942 CHD1O14646 1710 aa46.81■■■■■ 5.08
SRSF9-202ENST00000546942 WDR97A6NE52 1622 aa46.72■■■■■ 5.07
SRSF9-202ENST00000546942 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.64■■■■■ 5.06
SRSF9-202ENST00000546942 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.58■■■■■ 5.05
SRSF9-202ENST00000546942 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.58■■■■■ 5.05
SRSF9-202ENST00000546942 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.58■■■■■ 5.05
SRSF9-202ENST00000546942 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.58■■■■■ 5.05
SRSF9-202ENST00000546942 GRIN2BQ13224 1484 aa46.57■■■■■ 5.05
SRSF9-202ENST00000546942 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.53■■■■■ 5.04
SRSF9-202ENST00000546942 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.53■■■■■ 5.04
SRSF9-202ENST00000546942 SYNJ1O43426 1573 aa46.52■■■■■ 5.04
SRSF9-202ENST00000546942 TOP2BQ02880 1626 aa46.52■■■■■ 5.04
SRSF9-202ENST00000546942 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.52■■■■■ 5.04
SRSF9-202ENST00000546942 PBRM1Q86U86 1689 aa46.5■■■■■ 5.03
SRSF9-202ENST00000546942 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.5■■■■■ 5.03
SRSF9-202ENST00000546942 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.49■■■■■ 5.03
SRSF9-202ENST00000546942 ARHGEF11O15085 1522 aa46.47■■■■■ 5.03
SRSF9-202ENST00000546942 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.41■■■■■ 5.02
SRSF9-202ENST00000546942 SYNJ2O15056 1496 aa46.35■■■■■ 5.01
SRSF9-202ENST00000546942 CYB5RLQ6IPT4 315 aa46.19■■■■■ 4.98
SRSF9-202ENST00000546942 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.18■■■■■ 4.98
SRSF9-202ENST00000546942 ARAP1Q96P48 1450 aa46.05■■■■■ 4.96
SRSF9-202ENST00000546942 ADAMTS12P58397 1594 aa46.03■■■■■ 4.96
SRSF9-202ENST00000546942 GRIN2AQ12879 1464 aa45.99■■■■■ 4.95
SRSF9-202ENST00000546942 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.96■■■■■ 4.95
SRSF9-202ENST00000546942 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.93■■■■■ 4.94
SRSF9-202ENST00000546942 CEP170Q5SW79 1584 aa45.81■■■■■ 4.92
SRSF9-202ENST00000546942 NUP160Q12769 1436 aa45.77■■■■■ 4.92
SRSF9-202ENST00000546942 KIF27Q86VH2 1401 aa45.65■■■■■ 4.9
SRSF9-202ENST00000546942 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.59■■■■■ 4.89
SRSF9-202ENST00000546942 IGF1RP08069 1367 aa45.55■■■■■ 4.88
SRSF9-202ENST00000546942 TRHP20396 242 aaPredicted RBP45.53■■■■■ 4.88
SRSF9-202ENST00000546942 SHROOM2Q13796 1616 aa45.51■■■■■ 4.88
SRSF9-202ENST00000546942 CUL7Q14999 1698 aa45.44■■■■■ 4.87
SRSF9-202ENST00000546942 JPH4Q96JJ6 628 aa45.39■■■■■ 4.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms