Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 ZNF251-203ENST00000525191 618 ntTSL 314.61□□□□□ -0.075e-11■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 RBM6-216ENST00000478026 480 ntTSL 43.93□□□□□ -1.782e-7■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.41e-6■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 CYP4F12-216ENST00000550627 2264 ntTSL 214.77□□□□□ -0.042e-6■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 CYP4F12-206ENST00000546608 3256 ntTSL 29.55□□□□□ -0.882e-6■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 PSMA5-204ENST00000490870 1667 ntTSL 1 (best)10.31□□□□□ -0.761e-6■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 PSMA5-206ENST00000538610 1504 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -11e-6■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 RBM26-206ENST00000472143 2192 ntTSL 227.15■■□□□ 1.941e-6■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.881e-6■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.831e-6■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -01e-6■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 ETS2-203ENST00000432278 1033 ntTSL 518.89■□□□□ 0.618e-8■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.021e-6■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 TNFRSF14-207ENST00000451778 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 314.86□□□□□ -0.031e-6■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.188e-8■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 ETS2-202ENST00000360938 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.438e-8■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 ERBB3-215ENST00000550828 266 ntTSL 1 (best)13.39□□□□□ -0.278e-14■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.285e-6■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 MOV10-209ENST00000479858 400 ntTSL 314.99□□□□□ -0.015e-6■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 ARCN1-204ENST00000534182 1669 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.345e-6■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 ARCN1-205ENST00000614498 2238 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.765e-6■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 MYO19-216ENST00000616207 786 ntTSL 510.17□□□□□ -0.785e-6■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 MYO19-211ENST00000613551 556 ntTSL 48.11□□□□□ -1.115e-6■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 ARCN1-201ENST00000264028 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.225e-6■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.345e-6■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 TOP2A-205ENST00000581055 579 ntTSL 417.44■□□□□ 0.382e-19■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 LONP1-207ENST00000588589 684 ntTSL 214.1□□□□□ -0.159e-7■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 GOLGA4-204ENST00000429018 2036 ntTSL 1 (best)16.19■□□□□ 0.183e-7■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 PHYKPL-213ENST00000506001 583 ntTSL 317.46■□□□□ 0.394e-13■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 NSD2-223ENST00000513726 648 ntTSL 310.76□□□□□ -0.694e-6■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 UBFD1-206ENST00000566669 577 ntTSL 225.84■■□□□ 1.738e-14■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.168e-14■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 UBFD1-210ENST00000571064 794 ntTSL 321■□□□□ 0.958e-14■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.538e-14■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.168e-14■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 NEK6-211ENST00000454453 732 ntTSL 323.46■■□□□ 1.355e-7■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.295e-7■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 NDRG1-208ENST00000518094 347 ntTSL 27.5□□□□□ -1.212e-13■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 CDK18-206ENST00000462976 794 ntTSL 522.14■■□□□ 1.134e-7■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 CDK18-204ENST00000443813 591 ntTSL 418.55■□□□□ 0.564e-7■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 CDK18-218ENST00000507067 342 ntTSL 1 (best)17.23■□□□□ 0.354e-7■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 CDK18-215ENST00000506215 435 ntTSL 1 (best)15.57■□□□□ 0.084e-7■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 TINAGL1-210ENST00000498429 904 ntTSL 311.89□□□□□ -0.514e-6■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 GPS1-223ENST00000584229 535 ntTSL 324.34■■□□□ 1.493e-7■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 UBAP2L-210ENST00000441890 678 ntTSL 216.09■□□□□ 0.173e-6■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 RNPS1-210ENST00000564601 903 ntTSL 318.03■□□□□ 0.482e-6■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 SH3BP2-214ENST00000509677 1087 ntTSL 317.65■□□□□ 0.427e-8■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 TANK-214ENST00000456358 564 ntTSL 512.28□□□□□ -0.446e-10■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 MPP1-201ENST00000369531 519 ntTSL 312.45□□□□□ -0.424e-15■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 SRSF5-210ENST00000555412 572 ntTSL 213.52□□□□□ -0.251e-7■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.725e-18■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 EGLN3-208ENST00000551935 575 ntTSL 413.51□□□□□ -0.255e-18■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 TCERG1-215ENST00000515203 576 ntTSL 56.51□□□□□ -1.373e-23■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 GPAA1-211ENST00000529503 878 ntTSL 519.95■□□□□ 0.782e-16■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 GPAA1-210ENST00000528073 986 ntTSL 318.92■□□□□ 0.622e-16■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 GPAA1-204ENST00000525087 937 ntTSL 518.2■□□□□ 0.52e-16■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 GPAA1-214ENST00000530633 835 ntTSL 318.16■□□□□ 0.52e-16■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 GPAA1-205ENST00000525308 903 ntTSL 217.4■□□□□ 0.382e-16■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 GPAA1-203ENST00000524418 825 ntTSL 315.01□□□□□ -0.012e-16■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 GPAA1-208ENST00000527144 767 ntTSL 313.45□□□□□ -0.262e-16■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 RBM39-224ENST00000463098 869 ntTSL 214.69□□□□□ -0.064e-13■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 RBM39-222ENST00000461849 861 ntTSL 213.39□□□□□ -0.274e-13■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.324e-8■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 ZNF514-203ENST00000447814 554 ntTSL 48.96□□□□□ -0.984e-8■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 MYO19-219ENST00000620413 465 ntTSL 212.55□□□□□ -0.47e-7■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 MYO19-209ENST00000612097 580 ntTSL 58.94□□□□□ -0.987e-7■□□□□ 10.9
EFTUD2Q15029 VWDE-203ENST00000452576 5936 ntTSL 1 (best)13.13□□□□□ -0.315e-7■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 VWDE-201ENST00000275358 5260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.435e-7■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 VWDE-205ENST00000521169 4700 ntTSL 511.88□□□□□ -0.515e-7■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 VWDE-206ENST00000614403 4701 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.515e-7■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 FKBP10-204ENST00000464180 1129 ntTSL 219.16■□□□□ 0.668e-19■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 MCF2L-224ENST00000475524 604 ntTSL 414.94□□□□□ -0.022e-6■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 MCF2L-220ENST00000464800 720 ntTSL 213.5□□□□□ -0.252e-6■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 YARS-207ENST00000481895 1018 ntTSL 519.04■□□□□ 0.643e-11■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 MPP1-206ENST00000417435 970 ntTSL 516.86■□□□□ 0.299e-14■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 MPP1-207ENST00000428488 581 ntTSL 312.45□□□□□ -0.429e-14■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 MPP1-214ENST00000488694 550 ntTSL 24.78□□□□□ -1.649e-14■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 UBAC1-202ENST00000465873 882 ntTSL 215.3■□□□□ 0.042e-11■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 ETV4-209ENST00000587151 582 ntTSL 513.49□□□□□ -0.255e-8■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 TNFRSF14-206ENST00000442392 840 ntTSL 213.05□□□□□ -0.321e-9■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 HPN-204ENST00000593305 2175 ntTSL 220.76■□□□□ 0.911e-8■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 SNRNP70-203ENST00000544278 3221 ntTSL 1 (best)16.67■□□□□ 0.262e-10■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.223e-8■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 CLASP1-207ENST00000452274 3966 ntTSL 59.06□□□□□ -0.963e-6■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 EPB41-208ENST00000460378 5212 ntTSL 1 (best)9.63□□□□□ -0.875e-7■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 SNRPG-208ENST00000482975 1093 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.815e-9■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 SNRPG-204ENST00000438261 515 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.975e-9■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.075e-9■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.075e-9■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 HNF1A-206ENST00000538646 1649 ntTSL 1 (best)22.32■■□□□ 1.161e-6■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 HNF1A-209ENST00000541924 1594 ntTSL 1 (best)19.72■□□□□ 0.751e-6■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.661e-6■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.461e-6■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.331e-6■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 HNF1A-203ENST00000402929 3002 ntTSL 216.96■□□□□ 0.311e-6■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 HNF1A-214ENST00000560968 3030 ntTSL 1 (best)16.59■□□□□ 0.251e-6■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.241e-6■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 HNF1A-205ENST00000538626 582 ntTSL 1 (best)15.16■□□□□ 0.021e-6■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 HNF1A-213ENST00000544574 725 ntTSL 1 (best)15.16■□□□□ 0.021e-6■□□□□ 10.8
EFTUD2Q15029 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.161e-6■□□□□ 10.8
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