Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X3

SNX5, Sorting nexin-5, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX5Q9Y5X3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNX5Q9Y5X3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNX5Q9Y5X3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNX5Q9Y5X3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX5Q9Y5X3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX5Q9Y5X3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX5Q9Y5X3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX5Q9Y5X3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX5Q9Y5X3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX5Q9Y5X3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX5Q9Y5X3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX5Q9Y5X3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX5Q9Y5X3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX5Q9Y5X3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX5Q9Y5X3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX5Q9Y5X3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX5Q9Y5X3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX5Q9Y5X3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX5Q9Y5X3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX5Q9Y5X3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX5Q9Y5X3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX5Q9Y5X3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX5Q9Y5X3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX5Q9Y5X3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX5Q9Y5X3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX5Q9Y5X3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX5Q9Y5X3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX5Q9Y5X3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX5Q9Y5X3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX5Q9Y5X3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX5Q9Y5X3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX5Q9Y5X3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX5Q9Y5X3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX5Q9Y5X3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX5Q9Y5X3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX5Q9Y5X3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX5Q9Y5X3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX5Q9Y5X3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX5Q9Y5X3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX5Q9Y5X3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX5Q9Y5X3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX5Q9Y5X3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX5Q9Y5X3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX5Q9Y5X3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX5Q9Y5X3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX5Q9Y5X3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX5Q9Y5X3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNX5Q9Y5X3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNX5Q9Y5X3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNX5Q9Y5X3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNX5Q9Y5X3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNX5Q9Y5X3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNX5Q9Y5X3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNX5Q9Y5X3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNX5Q9Y5X3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX5Q9Y5X3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX5Q9Y5X3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX5Q9Y5X3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX5Q9Y5X3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX5Q9Y5X3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX5Q9Y5X3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX5Q9Y5X3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX5Q9Y5X3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX5Q9Y5X3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX5Q9Y5X3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX5Q9Y5X3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX5Q9Y5X3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX5Q9Y5X3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX5Q9Y5X3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX5Q9Y5X3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX5Q9Y5X3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX5Q9Y5X3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX5Q9Y5X3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX5Q9Y5X3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX5Q9Y5X3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX5Q9Y5X3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX5Q9Y5X3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX5Q9Y5X3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX5Q9Y5X3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX5Q9Y5X3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX5Q9Y5X3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX5Q9Y5X3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX5Q9Y5X3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX5Q9Y5X3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX5Q9Y5X3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX5Q9Y5X3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX5Q9Y5X3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX5Q9Y5X3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX5Q9Y5X3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX5Q9Y5X3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX5Q9Y5X3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX5Q9Y5X3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX5Q9Y5X3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX5Q9Y5X3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX5Q9Y5X3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX5Q9Y5X3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX5Q9Y5X3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX5Q9Y5X3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX5Q9Y5X3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX5Q9Y5X3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms