Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 ATXN2L-220ENST00000566080 329 ntTSL 32.01□□□□□ -2.091e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 EIF3E-208ENST00000519517 726 ntTSL 31.68□□□□□ -2.141e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 USP15-210ENST00000548836 579 ntTSL 31.62□□□□□ -2.151e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 XPO1-220ENST00000481214 720 ntTSL 21.47□□□□□ -2.174e-18■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 TARDBP-220ENST00000618606 584 ntTSL 21.34□□□□□ -2.192e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.186e-8■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 CPSF1-205ENST00000531042 580 ntTSL 515.73■□□□□ 0.116e-8■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.16e-8■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.162e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.182e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 FAM13B-202ENST00000420893 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.582e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 GLUL-205ENST00000461447 689 ntTSL 211.4□□□□□ -0.582e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.394e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.264e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 TFRC-204ENST00000421258 524 ntTSL 312.51□□□□□ -0.411e-9■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 VDAC2-214ENST00000543351 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.314e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 VDAC2-201ENST00000298468 931 ntTSL 56.01□□□□□ -1.454e-7■■■■■ 31.6
RBM22Q9NW64 AC013394.1-202ENST00000630790 4499 ntTSL 28.56□□□□□ -1.042e-6■■■■■ 31.5
RBM22Q9NW64 UBP1-212ENST00000492136 7394 ntTSL 26.85□□□□□ -1.313e-7■■■■■ 31.5
RBM22Q9NW64 CLK1-207ENST00000461981 3173 ntTSL 25.32□□□□□ -1.563e-7■■■■■ 31.5
RBM22Q9NW64 UBP1-206ENST00000464787 536 ntTSL 35.31□□□□□ -1.563e-7■■■■■ 31.5
RBM22Q9NW64 UBP1-207ENST00000466441 927 ntTSL 1 (best)4.7□□□□□ -1.663e-7■■■■■ 31.5
RBM22Q9NW64 UBP1-210ENST00000486388 928 ntTSL 34.61□□□□□ -1.673e-7■■■■■ 31.5
RBM22Q9NW64 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.783e-7■■■■■ 31.5
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RBM22Q9NW64 H2AFZ-203ENST00000511319 1254 ntTSL 1 (best)29.11■■■□□ 2.257e-11■■■■■ 31.5
RBM22Q9NW64 SLC26A5-215ENST00000487407 2098 ntTSL 224.58■■□□□ 1.532e-7■■■■■ 31.5
RBM22Q9NW64 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.082e-7■■■■■ 31.5
RBM22Q9NW64 MED15-222ENST00000473244 2733 ntTSL 1 (best)19.54■□□□□ 0.722e-7■■■■■ 31.5
RBM22Q9NW64 MED15-231ENST00000493216 4701 ntTSL 217.5■□□□□ 0.392e-7■■■■■ 31.5
RBM22Q9NW64 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.227e-11■■■■■ 31.5
RBM22Q9NW64 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.22e-7■■■■■ 31.5
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RBM22Q9NW64 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.182e-7■■■■■ 31.5
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RBM22Q9NW64 MTHFD2-202ENST00000409601 1865 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.392e-7■■■■■ 31.5
RBM22Q9NW64 MED15-223ENST00000476187 593 ntTSL 412.49□□□□□ -0.412e-7■■■■■ 31.5
RBM22Q9NW64 SLC26A5-204ENST00000356767 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.452e-7■■■■■ 31.5
RBM22Q9NW64 FUBP1-204ENST00000421641 802 ntTSL 512.11□□□□□ -0.472e-7■■■■■ 31.5
RBM22Q9NW64 SLC26A5-211ENST00000432958 2588 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.492e-7■■■■■ 31.5
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RBM22Q9NW64 PSMD13-207ENST00000527982 2200 nt11.86□□□□□ -0.512e-7■■■■■ 31.5
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RBM22Q9NW64 MED15-229ENST00000489651 3563 ntTSL 1 (best)11.78□□□□□ -0.522e-7■■■■■ 31.5
RBM22Q9NW64 MED15-226ENST00000478831 707 ntTSL 411.49□□□□□ -0.572e-7■■■■■ 31.5
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RBM22Q9NW64 MTHFD2-201ENST00000394053 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.652e-7■■■■■ 31.5
RBM22Q9NW64 MED15-230ENST00000492381 3619 ntTSL 210.82□□□□□ -0.682e-7■■■■■ 31.5
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RBM22Q9NW64 TUBA1B-206ENST00000550367 835 ntTSL 39.38□□□□□ -0.918e-8■■■■■ 31.5
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RBM22Q9NW64 PSMA3-207ENST00000554812 1279 ntTSL 28.91□□□□□ -0.982e-7■■■■■ 31.5
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RBM22Q9NW64 MTHFD2-208ENST00000489041 1135 ntTSL 28.07□□□□□ -1.122e-7■■■■■ 31.5
RBM22Q9NW64 SLC26A5-206ENST00000393727 2270 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.192e-7■■■■■ 31.5
RBM22Q9NW64 SLC26A5-210ENST00000423416 2374 ntTSL 27.2□□□□□ -1.262e-7■■■■■ 31.5
RBM22Q9NW64 CEP192-211ENST00000513432 8635 ntTSL 1 (best)7.13□□□□□ -1.272e-7■■■■■ 31.5
RBM22Q9NW64 CD53-204ENST00000476408 756 ntTSL 56.73□□□□□ -1.332e-7■■■■■ 31.5
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RBM22Q9NW64 PSMA3-209ENST00000555931 606 ntTSL 46.56□□□□□ -1.362e-7■■■■■ 31.5
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RBM22Q9NW64 AC005381.1-202ENST00000592716 574 ntTSL 56.3□□□□□ -1.42e-7■■■■■ 31.5
RBM22Q9NW64 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.422e-7■■■■■ 31.5
RBM22Q9NW64 PSMA3-208ENST00000555743 640 ntTSL 26.19□□□□□ -1.422e-7■■■■■ 31.5
RBM22Q9NW64 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.432e-7■■■■■ 31.5
RBM22Q9NW64 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.432e-7■■■■■ 31.5
RBM22Q9NW64 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.572e-7■■■■■ 31.5
RBM22Q9NW64 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.642e-7■■■■■ 31.5
RBM22Q9NW64 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.662e-7■■■■■ 31.5
RBM22Q9NW64 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.712e-7■■■■■ 31.5
RBM22Q9NW64 PSMA3-210ENST00000556321 500 ntTSL 23.34□□□□□ -1.872e-7■■■■■ 31.5
RBM22Q9NW64 PSMA3-211ENST00000557087 654 ntTSL 33.1□□□□□ -1.912e-7■■■■■ 31.5
RBM22Q9NW64 USP15-209ENST00000548620 816 ntTSL 31.98□□□□□ -2.098e-7■■■■■ 31.4
RBM22Q9NW64 ASPSCR1-216ENST00000583503 641 ntTSL 317.77■□□□□ 0.442e-25■■■■■ 31.4
RBM22Q9NW64 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.985e-7■■■■■ 31.4
RBM22Q9NW64 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.45e-7■■■■■ 31.4
RBM22Q9NW64 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.275e-7■■■■■ 31.4
RBM22Q9NW64 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.235e-7■■■■■ 31.4
RBM22Q9NW64 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.165e-7■■■■■ 31.4
RBM22Q9NW64 HMGB2-204ENST00000506267 629 ntTSL 322.64■■□□□ 1.212e-6■■■■■ 31.4
RBM22Q9NW64 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 31.4
RBM22Q9NW64 HMGB2-205ENST00000511316 1841 ntTSL 212.68□□□□□ -0.382e-6■■■■■ 31.4
RBM22Q9NW64 HMGB2-201ENST00000296503 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 31.4
RBM22Q9NW64 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.793e-10■■■■■ 31.3
RBM22Q9NW64 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.733e-10■■■■■ 31.3
RBM22Q9NW64 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.063e-10■■■■■ 31.3
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